2020 年 02 月 26 日 22:10 来源于 财新网
新型コロナウイルスの分離、検査、遺伝子配列決定は、新型コロナウイルス感染症の感染力と危険性を理解し判断するための基礎です。この研究はいつ、どのように始まったのでしょうか？1 月 11 日、数日間更新されなかった武漢衛生健康委員会の報告が初めて「原因不明のウイルス性肺炎」を「新型コロナウイルス感染による肺炎」と改名し、2020 年 1 月 10 日 24 時までに 41 例の新型コロナウイルス肺炎の初歩的診断があったと発表しました。
【財新網】（記者 高昱 彭岩鋒 杨睿 冯禹丁 马丹萌）追根溯源すると、2 月 24 日までに 2660 人以上が死亡し、77000 人以上が新型コロナウイルスに感染したことが確認されています。この SARS に近い新型コロナウイルスはいつ発見されたのでしょうか？財新の記者は多方面からのインタビューを通じて、関連論文やデータベースの資料を整理し、情報のパズルが徐々に明らかになってきました。
さまざまな証拠が示すところによれば、昨年 12 月末以前に、武漢の各病院から 9 名以上の不明肺炎症例のサンプルが採取され、遺伝子配列決定の結果、病原体は SARS 様コロナウイルスであることが示されました。これらの検査結果は次々と病院にフィードバックされ、衛生健康委員会や疾病予防管理システムに報告されました。1 月 9 日までに、中央テレビは「武漢ウイルス性肺炎病原体検査結果初歩評価専門家グループ」が正式に病原体を「新型コロナウイルス」と発表したと報じました。
最初の結果は 12 月 27 日に出ました。2019 年 12 月 15 日、65 歳の華南海鮮市場の男性配送員が発熱を始めました。12 月 18 日、彼は武漢市中心病院（南京路院区）の救急科に来院し、医師はコミュニティ獲得性肺炎の可能性を疑い、彼を入院させました。コミュニティ獲得性肺炎は、細菌、ウイルス、クラミジア、マイコプラズマなどのさまざまな微生物によって引き起こされる肺炎の総称で、主な臨床症状には咳嗽、痰の有無にかかわらず胸痛が含まれます。
12 月 22 日、この患者の病状が悪化し、ICU に入院しましたが、医師たちが使用したさまざまな抗生物質治療は効果がありませんでした。武漢市中心病院呼吸内科の主任医師である趙蘇教授は財新の記者に対し、12 月 24 日、呼吸内科の副主任医師がこの患者に気管支鏡サンプリングを行い、その後、患者の肺胞洗浄液サンプルを第三者検査機関である広州微遠基因科技有限公司に送って NGS 検査を行い、マクロゲノム学に基づく次世代高スループット遺伝子配列決定技術（mNGS）を利用して病原体を特定しようとしたと述べました。肺胞洗浄は、肺胞内の炎症性分泌物を除去し、呼吸機能を改善する治療法であり、下気道および肺の病気においては、肺胞洗浄液中の病原体の含有量が咽頭スワブよりも高いです。
微遠基因の正式名称は広州微遠基因科技有限公司で、2018 年 6 月に設立されました。その求人広告には、腫瘍学と感染病原学の精密医療に特化しており、次世代高スループット配列決定技術に基づく配列決定プラットフォーム（NGS）を持っていると記載されています。
「華大基因が配列決定技術を利用して以来、国内には多くの遺伝子配列決定会社が登場しました。これらの年、私たちのさまざまな医学会議で、次世代高スループット遺伝子配列決定技術が繰り返し紹介され、これらの会社も医薬品代表を各大病院に派遣して宣伝しています。」と趙蘇は財新の記者に語りました。華大基因（300676.SZ）の正式名称は深圳華大基因股份有限公司で、元々は北京華大基因研究センターと呼ばれ、1999 年に設立されました。国際人類ゲノム計画の中国部分、水稲およびジャイアントパンダのゲノム計画など、国際的に先進的なレベルの遺伝子研究をいくつも完了しました。2017 年 7 月に「遺伝子配列決定の第一株」として創業ボードに上場し、世界最大のゲノム学研究開発機関です。
別の武漢協和病院の医師も紹介しました。「1 回の検査で 600 万塩基配列、3000 元で、この 3000 元で病原体が何のウイルスまたは細菌であるかを特定できれば、命を救うことができるかもしれません。」
一般的に、遺伝子配列決定会社は 3 日後、つまり 12 月 27 日に検査結果をフィードバックするべきですが、微遠基因は書面報告を出しませんでした。「彼らはただ電話で通知してきて、新しいコロナウイルスだと言いました。」と趙蘇は言いました。この時、この患者はすでに 12 月 25 日に武漢同済病院に転院していました。
2020 年 2 月 21 日、この症例の遺伝子検査情報が WeChat 公式アカウント「微遠基因」の記事で公開されました。この記事には、中华医学杂志（英文版）が 1 月 27 日に新型コロナウイルスの発見の経緯を紹介する論文を発表し、微遠基因が新型コロナウイルスの早期発見に関与したと記載されています。
前述の中华医学杂志（英文版）に掲載された論文は、1 月 29 日に発表された「人間の重症肺炎を引き起こす新型コロナウイルスの同定：記述的研究」という記事を指しています。論文の著者は中国医学科学院 / 北京協和医学院病原生物学研究所（以下、中国医学科学院病原所）、中日友好病院、湖北省疾病予防管理センター、武漢市金銀潭病院、武漢市中心病院、広州微遠基因科技有限公司などの機関から来ています。微遠基因の最高技術責任者である許騰はこの論文の共同第一著者であり、CEO の李永軍と最高運営責任者の王小鋭は署名著者です。李永軍は以前、中国医学科学院病原所の生物情報分析員を務めていました。
この論文によると、研究者たちは湖北武漢金銀潭病院の 5 例の重症肺炎患者の臨床データと気管支肺胞洗浄サンプルを収集し、病原マクロゲノム学（mNGS）分析を行いました。その結果、これらのサンプルの中で、これまで報告されていない、SARS ウイルスの核酸配列の類似度が 79% のコロナウイルスが発見されました。文中には、これら 5 名の患者のサンプルの中で、最初に遺伝子配列決定が行われた臨床サンプルは 12 月 24 日に採取された 65 歳の患者のサンプルであると示されています。彼は 12 月 15 日に発症し、高熱、咳嗽、少痰の症状がありました。18 日に入院し、12 月 22 日に ICU に入院しました。16 日後も高熱が続き、重度の呼吸困難に進展しました。
上記の情報と高度に一致するのは、WeChat 公式アカウント「小山狗」が 1 月 28 日に発表した「新型コロナウイルスの初発見の経験を記録する」という記事です。著者はコメント欄で、広州黄埔にある民間企業に勤務していると自称し、文中に「2019 年 12 月 26 日、仕事を始めたばかりで、いつも通りその日の mNGS 病原微生物自動解釈結果をざっと見ていた。驚いたことに、あるサンプルが感受性病原体 ——SARS コロナウイルスを報告し、数十本の配列があり、このサンプルにはこれだけの意味のある病原体があった。心がざわつき、すぐにバックエンドで詳細な分析データを確認したところ、類似度はそれほど高くなく、約 94.5% しかなかった。結果の信頼性を確認するために、詳細な分析を開始した。探索版の分析結果は、この病原体が Bat SARS 様コロナウイルスに最も類似していることを示唆し、全体の類似度は約 87% で、SARS との類似度は約 81% であることがわかった。」
著者によれば、この患者のサンプルの採取時間も 12 月 24 日でした。文中には、「前端からこの患者が重症で、検査結果を急いで求めているというフィードバックがあったが、こんな重大な病原体は簡単に報告できないため、昼前に数人の上司と緊急会議を開き、さらに分析を進め、報告を遅らせることに決定し、同時に中国医学科学院病原所とデータを共有して一緒に分析することにした」と記載されています。中国医学科学院病原所は、前述の中华医学杂志（英文版）の論文の著者機関の一つであり、微遠基因の CEO である李永軍が以前勤務していた中国医学科学院病原所の直属上司は、中国工程院の副院長である王辰院士です。
12 月 27 日、この実験室はほぼ完全なウイルスの遺伝子配列を組み立て、データは同時に中国医学科学院病原所に共有されました。「基本的に、この患者のサンプルには Bat SARS 様コロナウイルスに類似した新型ウイルスが確かに存在することが確認できました。」と記事は書いています。「当時得られた情報は、この患者が故郷に帰ったことがあり、コウモリに接触した可能性があることを排除できないというものでした。問題の潜在的な深刻さに気づき、実験室を全面的に清掃・消毒し、サンプルを無害化して廃棄し、実験操作に関与したスタッフに関連監視を行いました。昼前には医師とコミュニケーションを取り、患者も隔離されました。」
「おそらく、私たちがこの新型コロナウイルスを初めて発見したのでしょう。」と「小山狗」記事は GISAID データベースのスクリーンショットを提供し、「GISAID データベースのウェブサイトに提出されたデータによれば、サンプル収集時間が最も早いのも私たちです。」と述べています。
GISAID は、世界的なインフルエンザウイルス共有データプラットフォームであり、研究者は登録後に彼らが抽出したウイルスの遺伝子配列をアップロードできます。各株には独自の番号が付与され、収集時間、提出日、提出した実験室などの情報も記録されています。財新の記者が確認したところ、サンプル収集時間に基づいて、GISAID 上で最も早い新型コロナウイルスの遺伝子配列は 2019 年 12 月 24 日に収集され、中国医学科学院病原所によって 1 月 11 日にアップロードされたことがわかりました。番号、名称などを比較すると、これは「小山狗」記事のスクリーンショットに示された彼らの会社が関与した検査のサンプル配列です。
記事はまた、12 月 27 日、28 日に同社のリーダーが病院や疾病予防管理センターと電話でコミュニケーションを取り、29 日、30 日には武漢で病院や疾病予防管理センターのリーダーに直接分析結果を報告したことに言及しています。「私たちのすべての分析結果や医学科学院病原所の分析結果を含めて。すべてが緊張、秘密、厳格な調査の中で行われていました（この時、病院や疾病予防管理センターの人々はすでに多くの類似患者がいることを知っており、私たちが検査結果をコミュニケーションした後、すでに緊急処理を開始していました）。」
上述の最も早く遺伝子配列決定が完了したサンプルの持ち主は、その後金銀潭病院で亡くなりました。この 12 月 27 日に新たに発見されたウイルスの研究成果は、その時点では何の役にも立ちませんでした。
「SARS コロナウイルス」がソーシャルメディアを引き起こす
実際、最も早く知られているこの例の他に、2019 年 12 月末に武漢市中心病院にはさらに 2 例の「原因不明の肺炎」の患者サンプルが異なる機関に送られ、遺伝子配列決定が行われました。そして、この 2 例のサンプルの検査結果は、異なる経路でこのパンデミックの公表に重大な影響を与えました。
12 月 27 日、41 歳の陳姓男性が武漢市中心病院南京路院区に来院しました。「彼は会計士で、武昌に住んでおり、漢口の華南海鮮市場には全く行ったことがありません。おそらく 12 月 16 日に明確な誘因もなく発熱し、最高体温 39.5°C、動悸、胸の圧迫感、活動後の呼吸困難、体力の著しい低下があり、最初は 12 月 22 日に江夏区第一人民病院で診察を受けましたが、改善しませんでした。」と趙蘇は財新の記者に語りました。「彼は私たちの病院の医師の知人で、27 日に私たちの病院に転院しました。やはり救急科に収容されました。」12 月 27 日の夕方、患者は当院の呼吸科 ICU で気管支鏡サンプリングを行い、今回のサンプルは別の NGS 検査を行っている北京博奥医学検査所に送られました。
12 月 30 日、北京博奥医学検査所はこの患者の送検報告を医師にフィードバックし、検査結果は直接「SARS コロナウイルス」（SARS コロナウイルス）でした。
財新の記者が入手したこの北京博奥医学検査所の検査報告書には、この患者のサンプルから SARS コロナウイルスと緑膿菌の高い信頼度の陽性指標が検出されたことが示されています。SARS コロナウイルスに関する説明は、単鎖正鎖 RNA ウイルスであり、このウイルスの感染経路は近距離の飛沫感染または患者の呼吸器分泌物への接触であり、明らかな感染性を持ち、複数の臓器系を累積的に影響を与える特異な肺炎を引き起こすことができ、非典型肺炎とも呼ばれます。
「彼らの遺伝子データベースは完全ではなく、再確認を行っていない可能性があるため、小さな誤りを犯しました。実際には SARS とは異なるもので、新型コロナウイルスの一種です。」とある遺伝子配列決定の専門家は財新の記者に語りました。
しかし、この小さな誤りを犯した検査報告が、武漢の医師たちの注意を直接引き起こし、ソーシャルメディアを通じて公衆への警告を発し、ある程度多くの人々の命を救いました。
12 月 30 日、北京博奥医学検査所の検査報告が武漢市中心病院の医師の WeChat に現れました。その日の午後 5 時 48 分、武漢市中心病院の眼科医である李文亮は同級生のグループに情報を発信しました。「華南フルーツ海鮮市場で 7 例の SARS が確認され、私たちの病院の救急科で隔離されています。」19 時 39 分、武漢市紅十字会病院の神経内科医である劉文は、仕事の WeChat グループ「協和紅会神内」で情報を発信し、「先ほど二病院（武漢市中心病院）後湖院区で 1 例の冠状感染性ウイルス肺炎が確認され、華南周辺が隔離されるかもしれません。SARS はほぼ確定です、看護師の妹たち、外に出ないでください。」20 時 48 分、武漢協和病院の腫瘍センターの医師である謝琳カは腫瘍センターの WeChat グループで「最近は華南海鮮市場に行かないでください。そこでは現在、多くの人が原因不明の肺炎（非典型肺炎に似ている）にかかっています。今日、私たちの病院は華南海鮮市場の肺炎患者を多く受け入れました。皆さん、マスクを着用し、換気に注意してください。」と発表しました —— この 3 人の医師はその後、警察からの警告を受けました。
その日、広州黄埔にいる「小山狗」の著者も上記の情報を知り、「12 月 30 日には、類似の症状の患者がまだかなり多いという情報を聞き、神経が一気に緊張しました。特に、30 日の午後、ある競合他社が別の患者のサンプルの中で同じウイルスを検出した可能性があるが、彼らは直接 SARS コロナウイルスを検出したという報告を発表し、一瞬にして情報が爆発しました…… 競合他社が私たちに配列を共有し、私が分析したところ、確かに同じウイルスでした！潜在意識の中で最初に思ったのは「このウイルスは感染性がある」ということでした！」
李文亮らが明らかにした蓋は、遺伝子会社の配列決定の物語と、臨床医の警告の物語が交差することを可能にしました。武漢市中心病院の医師たちは、次々と現れるウイルス性肺炎患者に対する通常の治療が効果がなく、遺伝子配列決定会社に答えを求めている一方で、華南海鮮市場に隣接する湖北省新华病院の呼吸器および重症医学科の主任である張繼先は 12 月 26 日に 4 名の原因不明の肺炎症例を連続して診察し、12 月 27 日に 4 名の「原因不明のウイルス性肺炎」を病院に報告しました。病院は江漢区疾病予防管理センターに報告しました。
12 月 28-29 日、新华病院は華南海鮮市場から来た 3 名の患者をさらに受け入れ、彼らは類似のウイルス性肺炎の症状を持っていました。後の報道によると、12 月 29 日午後 1 時、新华病院の副院長である夏文広は 10 名の専門家を招集し、これら 7 名の症例について議論しました。専門家たちは異常な状況であると一致して認識し、夏文広は直接省市両級衛生健康委員会疾病予防管理処に報告しました。同日に報告されたのは、武漢市中心病院の公衆衛生科も含まれています。その日の午後、湖北省、武漢市衛生健康委員会疾病予防管理処は、省、市、区の 3 級疾病予防管理センターに通知し、新华病院と市中心病院後湖院区が華南市場の暴露歴のある原因不明の肺炎患者を多く受け入れていることを通知し、緊急処置作業フローを開始するよう要求しました。湖北省疾病予防管理センター、武漢市疾病予防管理センターは江漢区、硚口区、東西湖区の疾病予防管理センターと共に疫学調査を開始し、武漢市金銀潭病院の業務副院長である黄朝林などが新华病院に赴き、6 名の患者を引き取り、武漢市同済病院も前述の市中心病院で最初に遺伝子検査を行った患者を金銀潭病院に転院させました。
12 月 30 日、三級疾病予防管理センターは「華南海鮮市場での多例肺炎症例の報告に関する調査処置報告」を作成しました。同日、武漢市衛生健康委員会は内部通知を発表し、武漢の多くの医療機関で確かに多例の原因不明の肺炎症例が続々と現れ、武漢華南海鮮卸売市場と関連があることを言及し、各医療機関に対し、近一週間に診察した類似の特徴を持つ原因不明の肺炎患者を報告するよう要求しました。
この報告は、張繼先が報告を続けたことによって引き起こされた武漢市衛生健康委員会の「原因不明の肺炎治療に関する緊急通知」であり、すぐにオンラインで公開され、遺伝子配列決定報告を見た李文亮ら医師の WeChat 警告と共に、武漢で発端となったこのパンデミック情報が初めて外部世界に伝わりました。
上海からの警告
武漢市中心病院の別の症例サンプルは、同様に華南海鮮市場に隣接する後湖院区から、1 日早く採取されました。患者も同じく陳姓で、福建省泉州出身の 41 歳の海鮮市場の個人経営者で、12 月 20 日に寒さを受けた後、高熱 40°C、全身の筋肉痛、咳嗽、膿痰、胸の圧迫感、息切れなどの症状が現れ、12 月 26 日に武漢市中心病院後湖院区に「発熱の原因を調べるため、肺部感染」で入院し、12 月 30 日に病院で気管支鏡サンプリングを行い、呼吸器洗浄液のサンプルの中に多くのサンプルを冷凍保存しました。
「多くのサンプルを保存した理由は、私たちが復旦大学附属上海市公共衛生臨床センター（以下、上海公衛センター）や武漢市疾病予防管理センターと国家重大科学技術プロジェクト『中国主要自然疫源性ウイルス資源』の共同研究を行っているためです。共同研究契約はすでに 5 年続いており、武漢市疾病予防管理センターは中部地域の臨床サンプルと環境標本の収集を担当し、定期的に上海公衛センターに送って病原体検査を行っています。彼らは生物安全レベル 3（BSL-3）の実験室を持っており、高スループット配列決定と生物情報分析プラットフォームを備えていますが、私たちの病院は武漢市疾病予防管理センターの哨点病院です。」と武漢中心病院の呼吸内科の趙蘇教授は説明しました。
12 月 30 日の午後、サンプルは武漢市疾病予防管理センターのある主任医師によって持ち去られました。1 月 2 日、武漢市疾病予防管理センターの別の研究者がサンプルをドライアイス、鉄の箱、発泡スチロール箱で厳重に包装し、他の動物標本と共に鉄道速達で上海に送られました。1 月 3 日、上海公共衛生臨床センターの張永振教授のチームがサンプルを受け取りました。このセンターは復旦大学に属し、張永振自身は中国疾病予防管理センター感染症予防管理所の研究員であり、復旦大学生物医学研究院、上海公衛センターの非常勤教授であり、近年、国家自然基金、国家重大プロジェクト、国家重点研究開発計画などの資金提供を受けて、人獣共通感染症や中国主要自然疫源性ウイルス資源の調査などの研究活動を行っています。武漢市中心病院を含む多くの病院や武漢市疾病予防管理センター、オーストラリアのシドニー大学などが研究チームのメンバーです。
1 月 5 日未明、張永振研究チームはサンプルから新型 SARS 様コロナウイルスを検出し、高スループット配列決定を通じてこのウイルスの全遺伝子配列を取得しました。配列決定データに基づいて描かれた系統樹も、武漢新型コロナウイルスが歴史上存在しなかったことを確認しました。上海公衛センターはその日、上海市衛生健康委員会や国家衛生健康委員会などの主管部門に報告し、新しいウイルスが SARS と同源であり、呼吸器を介して伝播する可能性があることを警告し、公共の場で相応の疾病予防管理措置を講じるよう提案しました。1 月 6 日、中国疾病予防管理センターは内部で二級緊急対応を開始しました。
「私たちは武漢市疾病予防管理センターや武漢市中心病院などと協力して新しい自然疫源性ウイルスを収集しており、これは国家重大プロジェクトの一部です。P3 実験室の使用も中国合格評価国家認定委員会の審査認定を受けています。」と上海公衛センターの研究者は財新の記者に語りました。「私たちは通常の研究であり、偶然の発見であり、重大な問題に関わるため、すぐに報告しました。」
少なくとも 9 つのサンプルが昨年末に収集され、検査に送られたことが確認されています。財新の記者は、広州微遠基因科技有限公司や北京博奥医学検査所のほかにも、数社の遺伝子配列決定会社が武漢病院から原因不明の肺炎症例のサンプルを取得したことを確認しました。この中には、2019 年 12 月 26 日に武漢協和病院から遺伝子配列決定の委託を受けた業界の「リーダー」である華大基因も含まれています。12 月 29 日、華大基因はこの症例のサンプルの遺伝子配列決定結果を完了し、ウイルスは SARS の遺伝子配列との類似性が 80% に達しましたが、SARS ではなく、以前には存在しなかったコロナウイルスの一種であることが示されました。華大基因はまた、彼らの SARS 検出キットを使用して症例を検査し、結果は陰性で、SARS ではないことを否定しました。
12 月 30 日、華大基因は遺伝子配列決定結果を口頭で武漢協和病院に報告し、病原体は新型コロナウイルスであり、SARS に似ていると述べ、病院に対して武漢市衛生健康委員会に報告するよう提案しました。
華大基因の関係者は財新の記者に対し、彼らが 12 月末に原因不明のウイルス性肺炎症例のサンプルの遺伝子配列決定を受けたとき、このウイルスが臨床で多くの人々に感染を引き起こしていること、さらには同じ家族に属する集団感染がすでに発生していることを知らなかったと述べました。「私たちは遺伝子配列決定の技術会社であり、毎日多くの配列決定の委託を受け、大量のウイルスに接触し、多くの新しいウイルスを発見します。コロナウイルスには多くの種類があり、以前には SARS を含めて人に関連する 6 種類のコロナウイルスしかなく、人に感染性が強いのは SARS と MERS だけです。当時、私たちはこのウイルスが「良い」か「悪い」かを知りませんでした。」
華大基因は武漢の地元病院と長年の協力関係にあり、財新の記者の調査によると、武漢の地元病院は 2019 年 12 月から少なくとも 30 例以上の難治性肺炎の症例サンプルを華大基因に委託して遺伝子配列決定を行いました。華大はその中で新型コロナウイルス感染による肺炎に属する 3 例を発見しました。12 月 26 日のこの例のほかに、残りの 2 例はそれぞれ 12 月 29 日と 30 日に収集されました。
財新の記者が入手した関連情報によると、12 月 30 日と 31 日、華大側は最近受け取った症例について高深度の再検査を行い、12 月 31 日には 3 例の SARS 様コロナウイルスを混合し、3 つのウイルス遺伝子配列断片を組み合わせて混合全遺伝子配列を形成しました。1 月 1 日、この混合された新型コロナウイルスの遺伝子配列が中国疾病予防管理センターに提供され、3 つの検査報告も武漢市衛生健康委員会に報告されました。同日、華大基因は全遺伝子配列を再度作成し、その日に全遺伝子配列を取得しました。1 月 3 日、華大基因は 3 つのサンプルのウイルスの全遺伝子配列決定を完了しました。
しかし、華大側はこれら 3 つのサンプルの新型コロナウイルスの遺伝子配列を外部に公表しませんでした。財新の記者が調査したところ、2020 年 1 月 19 日までに GISAID プラットフォームには 13 のサンプルの新型コロナウイルスの遺伝子配列がアップロードされていました。日本とタイの 3 つを除いて、残りの 10 はすべて中国の研究機関からアップロードされました。サンプル収集時間に基づくと、最も早いのは前述の 2019 年 12 月 24 日に収集され、中国医学科学院病原所によってアップロードされたものです。さらに 8 つのサンプルは 12 月 30 日に収集され、武漢市金銀潭病院と湖北省疾病予防管理センター（1 件）、金銀潭病院と中国科学院武漢ウイルス研究所（5 件）、中国疾病予防管理センターウイルス病予防管理所（2 件）からのものです。さらに、中国疾病予防管理センターウイルス病予防管理所は 2020 年 1 月 1 日に収集されたサンプルの遺伝子配列をアップロードしました。
これに関連して、湖北日报の報道によれば、12 月 30 日、金銀潭病院の院長である張定宇は、同院で最初に受け入れた 7 名の患者の気管支肺胞洗浄液を採取し、中国科学院武漢ウイルス研究所に送って検査を行いました。
業界の平均検査周期が 3 日と考えると、1 月 2 日頃には、上述の 8 つの 12 月 30 日に収集されたサンプルの遺伝子配列決定結果が出ているはずです。中国科学院武漢ウイルス研究所は公開書簡「武漢ウイルス研究所が新型コロナウイルス肺炎の研究攻関に全力を尽くす」において、12 月 30 日夜にウイルス研究所が金銀潭病院から送られた原因不明の肺炎サンプルを受け取り、72 時間の攻関の後、2020 年 1 月 2 日に新型コロナウイルスの全遺伝子配列を確定し、1 月 11 日に GISAID にアップロードしたと述べています。
前述の中华医学杂志（英文版）に掲載された論文も、2019 年 12 月 24 日から 2020 年 1 月 1 日までの 9 日間に、5 名の患者の肺胞洗浄液サンプルが採取され、検査分析に送られたことを示しています。そして、この 5 名の患者の中には、華南海鮮市場への接触歴がない者が 2 名います。
5 名の患者の中には、前述の 65 歳患者のサンプルのほかに、3 名の患者のサンプル採取時間が 2019 年 12 月 30 日であることがわかりました。その中で、2 号患者は華南海鮮市場で働く 49 歳の女性で、12 月 22 日から高熱、乾いた咳が始まり、5 日後に呼吸困難が現れ入院し、12 月 29 日に ICU に入院しました。3 号患者も女性で、52 歳、12 月 22 日に発病し、29 日に入院しましたが、彼女には海鮮市場への接触歴がありません。4 号患者は 41 歳の男性で、12 月 16 日から高熱、乾いた咳が始まり、22 日に入院しました —— この男性も海鮮市場への暴露歴がないことが明らかです。5 号患者の肺胞洗浄液サンプルは 2020 年 1 月 1 日に採取され、彼は華南海鮮市場で働く 61 歳の男性で、慢性肝疾患と腹部粘液腫を患い、7 日間の発熱、咳嗽、呼吸困難の後、地元の病院に入院し、1 月 2 日から ECMO による救命措置が行われましたが、後に亡くなりました。
この論文は、ある新型コロナウイルスが実験室で識別され、SARS ウイルスの核酸配列との類似度が 79% であり、系統発生的にはコウモリが持つ SARS 様コロナウイルスに最も近いが、独立した進化分岐を形成するコロナウイルス β 属株の配列であることを示しています。ウイルス分離を行い、形態確認と血清学的検査を実施した結果、最終的に新たな病原体が新型コロナウイルスであることが確認されました。このウイルスの受容体結合領域のアミノ酸配列は SARS コロナウイルスに類似しており、両ウイルスが人体細胞上の同じ受容体に結合する可能性があることを示しています。
2019 年 12 月末から 2020 年 1 月初めの数日を振り返ると、本来は無数の人々の運命を決定する重要な瞬間であるべきでした。しかし、その時点では、一般の人々はこのウイルスが将来的に引き起こす結果について全く知らなかったのです。
ある遺伝子配列決定会社の関係者は、2020 年 1 月 1 日に湖北省衛生健康委員会のある官員から電話を受け、武漢に新型コロナウイルス肺炎の症例サンプルが送られた場合、再検査はできないと通知されたと述べました。既存の症例サンプルは廃棄し、サンプル情報を外部に漏らさず、関連論文やデータを外部に発表しないように指示されました。「もし将来的に検出した場合は、必ず私たちに報告してください。」
1 月 3 日、国家衛生健康委員会の事務局は「重大な突発感染症防止管理における生物サンプル資源および関連研究活動の管理強化に関する通知」を発表しました。この国衛办科教函（2020）3 号文は、最近の武漢肺炎症例サンプルに関して、現在把握している病原学的特徴、感染性、病原性、臨床資料などの情報に基づき、病原情報がさらに明確になるまで、高病原性病原微生物（第二類）として管理することを一時的に決定し、関連サンプルの輸送は元衛生部の「感染人間の高病原性病原微生物菌（毒）種またはサンプル輸送管理規定」に従って行うべきであると述べています。病原関連の実験活動は、相応の防護レベルを持つ生物安全実験室で行うべきです。
3 号文はさらに、各関連機関は省級以上の衛生健康行政部門の要求に従い、指定された病原検査機関に生物サンプルを提供し、病原学的検査を行い、引き渡し手続きを行うべきであると規定しています。未承認の場合、他の機関や個人に生物サンプルおよび関連情報を提供してはならず、関連医療機関から取得した関連症例の生物サンプルを持つ機関や個人は、直ちにサンプルを現地で廃棄するか、国家指定の保管機関に送付し、関連実験活動の記録および実験結果情報を適切に保存するべきです。パンデミック防止作業期間中、各種機関が病原学的検査任務に伴って生じた情報は特殊な公共資源に属し、いかなる機関や個人も勝手に病原検査や実験活動結果などの情報を外部に発表してはならず、関連論文や成果の発表は委託部門の審査同意を得る必要があります。
どの機関が「指定病原検査機関」に該当するかについては、文書には言及されていません。ウイルス学者によれば、中国科学院武漢ウイルス研究所でさえ、一時的に病原検査を停止し、既存のサンプルを廃棄するよう求められたことがあるといいます。「現行の《伝染病防治法》によれば、感染症の実験室検査、診断、病原学的同定は各級疾病予防管理機関の法定責任であり、国家および省級の疾病予防管理システム機関のみが感染症の病原学的同定を行う権限を持っています。中国科学院武漢ウイルス研究所は明らかにこの範疇には含まれず、ましてや未承認の商業研究機関は言うまでもありません。」
おそらくそのため、12 月 30 日にウイルスサンプルを受け取った中国科学院ウイルス研究所は、2020 年 1 月 1 日にウイルス分離を行い、1 月 2 日にウイルスの遺伝子配列決定を完了し、1 月 5 日にウイルス株を分離し、1 月 9 日に国家ウイルス資源庫への登録および標準化保管を完了しました。これらの研究作業は明らかに日夜を問わず行われなければならず、外部に公表されることはなく、2 月に外部からの噂攻撃に直面したときに、ようやく一言二言の開示が行われました。
1 月 9 日、中央テレビは、中国疾病予防管理センターを中心とした「武漢ウイルス性肺炎病原体検査結果初歩評価専門家グループ」が病原体を新型コロナウイルスであると確認し、「2020 年 1 月 7 日 21 時までに、実験室で新型コロナウイルスが検出され、ウイルスの全遺伝子配列を取得し、核酸検査法で新型コロナウイルス陽性結果が 15 例検出され、1 例の陽性患者サンプルからこのウイルスが分離され、電子顕微鏡下で典型的なコロナウイルス形態を呈している」と報じました。
1 月 11 日、張永振研究チームはこのウイルスの遺伝子配列情報を「ウイルス学組織」Virologic.org ウェブサイトと GenBank に共有し、世界で最初にこのウイルスの配列を公表したチームとなりました。
当晩、国家衛生健康委員会は中国が WHO と新型コロナウイルスの遺伝子配列情報を共有することを発表しました。翌日、異なる患者からの 5 つのウイルス遺伝子配列が国家衛生健康委員会のリーダーグループによって世界的に共有されるインフルエンザウイルスデータベース GISAID に発表されました。この WHO に共有された新型コロナウイルスの遺伝子配列情報がどの機関から来たのかについて、中国疾病予防管理センターの主任である高福は財新の記者に対し、遺伝子配列は 3 つの機関から来ており、中国疾病予防管理センター、中国医学科学院、そして中国科学院の 3 者による共同の攻関であると述べました。WHO は、武漢の原因不明のウイルス性肺炎に関する詳細情報を中国国家衛生健康委員会から受け取ったことを確認し、患者から検出された新型コロナウイルスの遺伝子配列情報が他国の特定診断ツールの開発に重要な意義を持つことを述べました。
この時点で、誰が最初に科学の王冠の宝石を摘み取ったのかを詳しく調べる必要はありません。なぜなら、新型コロナウイルスの最初の遺伝子配列決定からすでに 15 日が経過しているからです。
1 月 11 日、数日間更新されなかった武漢衛生健康委員会の報告が初めて「原因不明のウイルス性肺炎」を「新型コロナウイルス感染による肺炎」と改名し、2020 年 1 月 10 日 24 時までに 41 例の新型コロナウイルス肺炎の初歩的診断があったと発表しました。同じ日に、湖北の「二会」が開催されました。1 月 17 日まで湖北の「二会」が終了するまで、この数字は増加しませんでした。
財新の記者 赵今朝、実習記者 黄雨馨もこの記事に貢献しました。
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さらに詳しい報道は、【特集】新型コロナウイルス肺炎防疫全記録（リアルタイム更新中）をご覧ください。病院が収集し、遺伝子配列決定により病原体が SARS 様コロナウイルスであることが示され、これらの検査結果は次々と病院にフィードバックされ、衛生健康委員会や疾病予防管理システムに報告されました。図 / 財新記者 蔡颖莉
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